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GenFish发布:基于ProTargetBench的生成式靶点检索

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AI 综述

2026年10月20日,Zhichao Deng等人发布GenFish及基准ProTargetBench。ProTargetBench收录20,431个UniProt审查的人类蛋白,区分实验不活性与未测量关联,支持从完整目录中恢复实验阳性结果。 GenFish通过残差向量量化将冻结蛋白质语言模型特征转化为语义标识符。在198个留出分子测试中,其全目录检索指标均值超越四个判别式神经基线和三个非神经基线,确立了生成式检索在反向靶点垂钓中的范式。

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报道时间线

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10月20日
  1. arXiv · ML
    GenFish 基于蛋白质组规模基准 ProTargetBench 的反向靶点垂钓生成检索方法

    GenFish 通过残差向量量化将冻结蛋白质语言模型特征转化为语义标识符,在 198 个留出分子上,其全目录检索指标均值超越四个判别式神经基线和三个非神经基线。 ProTargetBench 包含 20,431 个 UniProt 审查的人类蛋白,区分实验不活性与未测量关联,并支持完整目录中实验阳性结果的恢复。 该工作确立了生成式检索在不完整生物活性记录下进行反向靶点垂钓的原则性范式。

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