arXiv · ML· Zhichao Deng, Haichuan Tan, Xin Hong, Huaizhi Wang, Tao Huang, Bowen Gao, Yanyan Lan·· 6 小时前AI 评分26
GenFish 基于蛋白质组规模基准 ProTargetBench 的反向靶点垂钓生成检索方法
Generative Retrieval for Reverse Target Fishing with a Proteome-Scale Benchmark
AI 导读
GenFish 通过残差向量量化将冻结蛋白质语言模型特征转化为语义标识符，在 198 个留出分子上，其全目录检索指标均值超越四个判别式神经基线和三个非神经基线。 ProTargetBench 包含 20,431 个 UniProt 审查的人类蛋白，区分实验不活性与未测量关联，并支持完整目录中实验阳性结果的恢复。 该工作确立了生成式检索在不完整生物活性记录下进行反向靶点垂钓的原则性范式。
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