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arXiv · ML· Yuwei Miao, Jingquan Yan, Hehuan Ma, Thao M. Dang, Lin Xu, Siyuan Zhang, Junzhou Huang·· 7 小时前AI 评分26

CytoWave: 面向单细胞扰动响应预测的扰动中心预训练框架

CytoWave: Perturbation-Centric Pretraining for Single-Cell Response Prediction

AI 导读

提出扰动中心预训练框架 CytoWave,用于单细胞基因扰动响应预测。该框架利用经直系同源统一的多物种大规模扰动数据集,采用两阶段训练:第一阶段通过掩蔽基因表达恢复学习对照细胞状态,第二阶段结合对比目标预训练以预测扰动后的基因表达。严格的数据集留出评估证明其在多种条件组合下具有稳定有效的性能。

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