跳到正文
arXiv · AI· Ramon Gonzalez (Mentomy AI)·· 7 小时前AI 评分22

评估机器学习模型在Neoantigen免疫原性预测中的表现及SHAP解释的局限性

Benchmarking Machine-Learning Classifiers for Neoantigen Immunogenicity Prediction and the Limits of SHAP Interpretability

AI 导读

该研究构建了包含60种配置模型在199个验证newtiantigen上的基准测试,指出线性模型优于梯度提升和神经网络,且SHAP在高基数特征上失效。 基准测试采用分层交叉验证,通过特征消融发现HLA基因是主要驱动因素。 建议对高基数分类注解释SHAP值时进行随机标签对照。

来源:arXiv · AI · arxiv.org