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arXiv · AI· Mateusz Praski, Jakub Adamczyk, Wojciech Czech·· 8 小时前AI 评分20

28个预训练分子嵌入模型基准测试:CheMeleon 和 ECFP 表现最优

Benchmarking Pretrained Molecular Embedding Models For Molecular Representation Learning

AI 导读

研究在受控框架下评估了28个预训练分子嵌入模型,使用层级贝叶斯Bradley-Terry统计检验。 在25个分类数据集中,除 CheMeleon 外的所有神经模型均未胜过经典的 ECFP count fingerprint,而外部验证显示两种方法无明确优势。 结果挑战了分子表示学习中感知到的进步,并凸显了领域内亟需严格评估标准。

来源:arXiv · AI · arxiv.org