跳到正文
arXiv · AI· Hanlin Xiao, Eriko Takano, Mauricio A. \'Alvarez, Rainer Breitling·· 8 小时前AI 评分34

BGC-Bench:面向生物合成基因簇的多粒度多模态基准设计框架

Data-Scarce, Multi-Granular, Multimodal: Benchmark Design for Biosynthetic Gene Clusters

AI 导读

论文提出 BGC-Bench 基准设计框架,旨在提升生物合成基因簇(BGCs)深度学习模型的评估区分度。 该基准源自 MIBiG 数据集,包含五项任务,在十二种编码器及核苷酸、氨基酸、Pfam 结构域等输入类型下测试,并引入主动学习设置以应对标签稀缺问题。 实验表明无单一表征在所有任务中占优,最优粒度取决于生物尺度,该框架可推广至 BGC 之外的基准设计。

来源:arXiv · AI · arxiv.org