arXiv · ML· Rui Qiao, Lei Xin, Baozhen Shan·· 3 小时前AI 评分25
NovoCRF:基于前缀质量晶格的全局归一化从头肽段测序方法
NovoCRF: Globally Normalized De Novo Peptide Sequencing on a Prefix-Mass Lattice
AI 导读
NovoCRF 提出了基于前缀质量作为状态的 CRF 模型,在七个数据集上将平均肽段召回率提升至 42.4%,氨基酸召回率 64.0%,较 Casanovo v5 显著领先。 该模型仅含 31 万参数,在 18 个 CPU 线程下速度达 1,746 spectra/s,吞吐量是 Casanovo GPU 版本的 55 倍,且能搜索未参与训练的修改类型。
来源:arXiv · ML · arxiv.org